第一，地理环境与生活习惯影响。农村土地面积辽阔，居民住房呈碎片化。所以，没有集中搜集污水的设施，甚至一些偏远山区仍然延续河边洗衣形式，增加河水内氮磷含量，水体逐渐营养化。第二，养殖业污染排放多。农村养殖业发展迅速，各类畜禽养殖场诸多，畜禽粪便与宰杀时废水、废弃物排放影响水质。另外，放牧时畜禽随意游牧进一步扩大污染面积。第三，农药化肥的利用。化肥对农作物生长具有积极作用，但由于农民施肥方法不当，导致自然生态系统受到破坏。此外，农药喷洒对环境与健康产生影响，特别是有机难降解化合物，渗透地表水中扩大污染面积。