农村生活污水中含有大量的含 N、P 元素的有机污染物，这些污染物若排放过度，超出湖泊和河流所能承受的环境容量和生态承载能力，必将引起水体富营养化，大量水生动物死亡，最终破坏水体，引发水质恶化。2007 年，全国重点流域 40 %的断面水质达不到治理要求，70 %江河水系被污染，75 %的湖泊富营养化。

     而在农村，这些突出的水污染问题有着加重的趋势。截止1997~2009 年，城镇生活污水排放量增长了 88 %，每年的增长率接近 7%。七大江河水系中劣五类水质占 41 %，近 80 %河流受到不同程度的污染，在农村约 7 亿人的日常饮用水中大肠杆菌超标，约 1.9 亿人的饮用水中含有大量有害物质，人口的患病率和死亡率均与用水不洁有关。农村污水区别于城市污水，主要以冲厕污水，洗澡洗衣用水，厨房污水为主，污水中有机物含量普遍低低于城市污水，主要污染物为 COD，氮和磷，水质相对稳定。